Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tlr8P58682 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tlr8P58682 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tlr8P58682 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tlr8P58682 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tlr8P58682 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tlr8P58682 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms