Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnbpP53996 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CnbpP53996 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnbpP53996 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnbpP53996 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CnbpP53996 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CnbpP53996 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms