Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa6P50704 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa6P50704 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa6P50704 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa6P50704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa6P50704 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa6P50704 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa6P50704 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa6P50704 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa6P50704 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa6P50704 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa6P50704 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa6P50704 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa6P50704 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa6P50704 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms