Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmod1P49813 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmod1P49813 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmod1P49813 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmod1P49813 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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