Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tac1P41539 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tac1P41539 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tac1P41539 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tac1P41539 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tac1P41539 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tac1P41539 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tac1P41539 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tac1P41539 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tac1P41539 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms