Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sftpa1P35242 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sftpa1P35242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sftpa1P35242 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sftpa1P35242 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms