Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KrasP32883 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KrasP32883 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KrasP32883 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KrasP32883 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KrasP32883 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KrasP32883 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KrasP32883 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KrasP32883 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KrasP32883 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KrasP32883 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KrasP32883 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KrasP32883 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KrasP32883 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KrasP32883 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KrasP32883 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KrasP32883 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KrasP32883 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KrasP32883 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KrasP32883 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KrasP32883 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KrasP32883 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KrasP32883 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KrasP32883 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KrasP32883 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KrasP32883 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KrasP32883 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KrasP32883 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KrasP32883 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KrasP32883 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KrasP32883 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KrasP32883 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KrasP32883 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KrasP32883 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KrasP32883 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KrasP32883 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KrasP32883 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KrasP32883 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KrasP32883 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KrasP32883 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KrasP32883 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KrasP32883 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KrasP32883 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KrasP32883 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KrasP32883 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KrasP32883 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KrasP32883 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KrasP32883 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KrasP32883 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KrasP32883 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KrasP32883 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KrasP32883 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KrasP32883 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KrasP32883 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KrasP32883 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KrasP32883 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KrasP32883 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KrasP32883 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KrasP32883 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KrasP32883 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KrasP32883 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KrasP32883 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KrasP32883 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KrasP32883 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KrasP32883 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KrasP32883 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KrasP32883 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KrasP32883 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KrasP32883 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KrasP32883 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KrasP32883 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KrasP32883 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KrasP32883 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms