Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gsx2P31316 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gsx2P31316 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gsx2P31316 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gsx2P31316 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms