Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cbx2P30658 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cbx2P30658 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cbx2P30658 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbx2P30658 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cbx2P30658 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx2P30658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms