Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VtnP29788 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VtnP29788 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VtnP29788 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VtnP29788 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VtnP29788 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VtnP29788 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VtnP29788 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VtnP29788 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VtnP29788 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VtnP29788 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VtnP29788 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VtnP29788 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VtnP29788 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VtnP29788 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VtnP29788 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VtnP29788 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VtnP29788 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VtnP29788 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VtnP29788 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VtnP29788 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VtnP29788 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VtnP29788 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VtnP29788 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VtnP29788 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VtnP29788 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VtnP29788 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VtnP29788 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VtnP29788 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VtnP29788 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VtnP29788 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VtnP29788 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VtnP29788 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VtnP29788 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VtnP29788 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VtnP29788 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VtnP29788 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VtnP29788 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VtnP29788 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VtnP29788 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VtnP29788 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VtnP29788 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VtnP29788 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VtnP29788 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VtnP29788 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VtnP29788 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VtnP29788 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VtnP29788 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VtnP29788 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VtnP29788 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VtnP29788 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VtnP29788 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VtnP29788 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VtnP29788 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VtnP29788 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VtnP29788 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VtnP29788 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VtnP29788 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VtnP29788 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VtnP29788 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VtnP29788 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VtnP29788 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VtnP29788 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VtnP29788 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VtnP29788 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VtnP29788 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
VtnP29788 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VtnP29788 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VtnP29788 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VtnP29788 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VtnP29788 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VtnP29788 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VtnP29788 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VtnP29788 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VtnP29788 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VtnP29788 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VtnP29788 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VtnP29788 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VtnP29788 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VtnP29788 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VtnP29788 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VtnP29788 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VtnP29788 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VtnP29788 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms