Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa4P28311 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa4P28311 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa4P28311 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa4P28311 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa4P28311 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa4P28311 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa4P28311 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa4P28311 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa4P28311 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms