Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lef1P27782 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lef1P27782 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lef1P27782 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lef1P27782 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lef1P27782 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms