Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P20040 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P20040 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P20040 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P20040 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P20040 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P20040 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P20040 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P20040 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P20040 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P20040 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P20040 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P20040 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P20040 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P20040 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P20040 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P20040 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P20040 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P20040 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P20040 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P20040 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P20040 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P20040 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P20040 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
P20040 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P20040 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P20040 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P20040 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P20040 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P20040 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P20040 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P20040 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P20040 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P20040 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P20040 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P20040 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P20040 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P20040 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P20040 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P20040 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P20040 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P20040 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P20040 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P20040 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P20040 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P20040 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P20040 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P20040 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P20040 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P20040 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P20040 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P20040 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P20040 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P20040 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P20040 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P20040 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P20040 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P20040 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P20040 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P20040 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P20040 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P20040 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P20040 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P20040 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P20040 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P20040 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P20040 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P20040 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P20040 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P20040 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P20040 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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