Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MdkP12025 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MdkP12025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MdkP12025 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MdkP12025 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MdkP12025 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MdkP12025 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MdkP12025 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MdkP12025 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MdkP12025 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MdkP12025 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MdkP12025 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MdkP12025 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MdkP12025 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MdkP12025 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MdkP12025 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MdkP12025 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MdkP12025 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MdkP12025 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MdkP12025 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MdkP12025 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MdkP12025 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MdkP12025 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MdkP12025 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MdkP12025 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MdkP12025 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MdkP12025 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MdkP12025 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MdkP12025 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MdkP12025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MdkP12025 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MdkP12025 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MdkP12025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MdkP12025 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MdkP12025 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MdkP12025 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MdkP12025 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MdkP12025 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MdkP12025 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MdkP12025 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MdkP12025 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MdkP12025 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MdkP12025 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MdkP12025 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MdkP12025 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MdkP12025 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MdkP12025 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MdkP12025 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MdkP12025 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MdkP12025 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MdkP12025 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MdkP12025 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MdkP12025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MdkP12025 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MdkP12025 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MdkP12025 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms