Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4P10628 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd4P10628 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4P10628 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms