Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb3P09026 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb3P09026 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb3P09026 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms