Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06320 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06320 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06320 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06320 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06320 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06320 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06320 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06320 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06320 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06320 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06320 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06320 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06320 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06320 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06320 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06320 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06320 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06320 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06320 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06320 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06320 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06320 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06320 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06320 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06320 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06320 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06320 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06320 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06320 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06320 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06320 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06320 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06320 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06320 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06320 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06320 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06320 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06320 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06320 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06320 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms