Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mtnd1P03888 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtnd1P03888 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtnd1P03888 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mtnd1P03888 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms