Protein–RNA interactions for Protein: O89103

Cd93, Complement component C1q receptor, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd93O89103 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd93O89103 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd93O89103 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd93O89103 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd93O89103 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd93O89103 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd93O89103 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd93O89103 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd93O89103 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd93O89103 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd93O89103 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd93O89103 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd93O89103 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd93O89103 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd93O89103 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd93O89103 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd93O89103 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd93O89103 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd93O89103 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd93O89103 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd93O89103 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd93O89103 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms