Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc6O88978 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc6O88978 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc6O88978 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc6O88978 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc6O88978 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms