Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Orc4O88708 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Orc4O88708 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Orc4O88708 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Orc4O88708 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Orc4O88708 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Orc4O88708 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Orc4O88708 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Orc4O88708 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Orc4O88708 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Orc4O88708 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Orc4O88708 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Orc4O88708 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Orc4O88708 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Orc4O88708 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Orc4O88708 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Orc4O88708 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Orc4O88708 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Orc4O88708 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Orc4O88708 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Orc4O88708 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Orc4O88708 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms