Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaskO70589 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CaskO70589 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaskO70589 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaskO70589 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaskO70589 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaskO70589 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CaskO70589 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaskO70589 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaskO70589 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaskO70589 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaskO70589 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaskO70589 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaskO70589 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaskO70589 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaskO70589 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaskO70589 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaskO70589 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaskO70589 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaskO70589 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaskO70589 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaskO70589 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CaskO70589 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CaskO70589 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CaskO70589 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CaskO70589 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CaskO70589 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CaskO70589 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CaskO70589 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CaskO70589 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CaskO70589 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CaskO70589 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CaskO70589 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CaskO70589 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CaskO70589 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CaskO70589 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CaskO70589 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CaskO70589 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CaskO70589 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CaskO70589 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CaskO70589 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CaskO70589 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CaskO70589 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CaskO70589 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CaskO70589 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CaskO70589 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CaskO70589 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CaskO70589 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CaskO70589 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CaskO70589 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CaskO70589 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CaskO70589 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CaskO70589 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CaskO70589 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CaskO70589 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CaskO70589 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CaskO70589 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CaskO70589 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CaskO70589 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CaskO70589 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CaskO70589 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CaskO70589 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CaskO70589 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CaskO70589 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CaskO70589 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CaskO70589 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CaskO70589 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CaskO70589 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CaskO70589 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CaskO70589 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CaskO70589 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CaskO70589 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CaskO70589 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms