Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pja1O55176 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja1O55176 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pja1O55176 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pja1O55176 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja1O55176 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pja1O55176 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja1O55176 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja1O55176 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja1O55176 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pja1O55176 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja1O55176 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pja1O55176 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pja1O55176 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja1O55176 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pja1O55176 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms