Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpd52l1O54818 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpd52l1O54818 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tpd52l1O54818 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52l1O54818 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms