Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf12O35738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf12O35738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf12O35738 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf12O35738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf12O35738 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf12O35738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf12O35738 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf12O35738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf12O35738 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf12O35738 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms