Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rabep1O35551 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rabep1O35551 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rabep1O35551 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rabep1O35551 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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