Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atn1O35126 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atn1O35126 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atn1O35126 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atn1O35126 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atn1O35126 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atn1O35126 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atn1O35126 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atn1O35126 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atn1O35126 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atn1O35126 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atn1O35126 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atn1O35126 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atn1O35126 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms