Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif1cO35071 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif1cO35071 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif1cO35071 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif1cO35071 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms