Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Barx2O08686 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Barx2O08686 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Barx2O08686 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Barx2O08686 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Barx2O08686 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Barx2O08686 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Barx2O08686 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Barx2O08686 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Barx2O08686 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Barx2O08686 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Barx2O08686 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Barx2O08686 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Barx2O08686 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Barx2O08686 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Barx2O08686 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms