Protein–RNA interactions for Protein: M0QWW3

Gm3187, Predicted gene 3187 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3187M0QWW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3187M0QWW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3187M0QWW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3187M0QWW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3187M0QWW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3187M0QWW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms