Protein–RNA interactions for Protein: K7N6W5

Gm17019, Predicted gene 17019, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17019K7N6W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17019K7N6W5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17019K7N6W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17019K7N6W5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17019K7N6W5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms