Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3542K7N6U2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3542K7N6U2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3542K7N6U2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3542K7N6U2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms