Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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