Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20795J3QP49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20795J3QP49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20795J3QP49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms