Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgxb3G3X9M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgxb3G3X9M3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgxb3G3X9M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms