Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8444F6XS56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8444F6XS56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8444F6XS56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8444F6XS56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8444F6XS56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8444F6XS56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms