Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5861F6VCN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5861F6VCN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5861F6VCN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5861F6VCN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5861F6VCN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms