Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf212F6TQD1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf212F6TQD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms