Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3072F6SKY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3072F6SKY8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms