Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms