Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc7bE9Q9Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms