Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC051665E9Q623 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC051665E9Q623 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051665E9Q623 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051665E9Q623 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051665E9Q623 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms