Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap11-1E9Q2E9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap11-1E9Q2E9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms