Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp3E9Q1T6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp3E9Q1T6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp3E9Q1T6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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