Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930426L09RikE9Q0N7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930426L09RikE9Q0N7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930426L09RikE9Q0N7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930426L09RikE9Q0N7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930426L09RikE9Q0N7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4930426L09RikE9Q0N7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms