Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm20425E9Q035 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm20425E9Q035 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm20425E9Q035 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm20425E9Q035 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm20425E9Q035 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm20425E9Q035 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms