Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph10bE9PYQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rsph10bE9PYQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph10bE9PYQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph10bE9PYQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph10bE9PYQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms