Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp839E9PUU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp839E9PUU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp839E9PUU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp839E9PUU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp839E9PUU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms