Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AU019823E9PUQ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AU019823E9PUQ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AU019823E9PUQ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU019823E9PUQ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU019823E9PUQ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU019823E9PUQ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AU019823E9PUQ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AU019823E9PUQ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms