Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna7C0LLJ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna7C0LLJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna7C0LLJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna7C0LLJ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms