Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1bB9EJ57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mterf1bB9EJ57 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1bB9EJ57 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1bB9EJ57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms