Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf11cB4XVP9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11cB4XVP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11cB4XVP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11cB4XVP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms